紀雅惠博士在國家衛生研究院生物技術與藥物研究組，從事博士後研究期間參與了抗SARS-CoV藥物與抗C型肝炎病毒藥物之研究，其研究結果發表在Biochemistry Biophysics Research Communication, Journal of Virological Methods等國際期刊，並幫助篩選出數個抗SARS藥物。  

紀博士在赴美國國家衛生院(NIH)博士後研究期間，建立了數個小鼠動物模式，分別探討抑制微小管抗癌藥物Vincristine，在細胞分裂周期檢查點因子(spindle assembly checkpoint)之缺陷小鼠癌症發生之角色、抑癌基因p53與細胞分裂周期檢查點因子之交互作用與癌症發生的關係、核膜蛋白SUN1在小鼠配子發育(gametogenesis)時的角色。紀博士發現細胞分裂周期檢查點因子，能抑制p53缺陷所引發之癌症發生，而在有細胞分裂周期檢查點因子的缺陷小鼠中，抗癌藥物Vincristine不但不能抑制癌症發生，反而增加小鼠之癌症發生率。紀博士並發現在SUN1缺陷小鼠中，因進行減數分裂之染色體無法正確接著在核膜上，因此減數分裂無法完成，導致小鼠不孕。除小鼠動物模式之建立，紀博士並探討細胞分裂周期檢查點因子與核膜蛋白在細胞周期之角色，並發現細胞分裂周期檢查點因子MAD1，能被PLK1激脢磷酸化，及核膜蛋白與組蛋白乙醯化因子之交互作用，能幫助細胞分裂後染色體結構鬆開之機制。其研究結果發表在Cancer Research, Journal of Biological Chemistry, Internal Journal of Cancer, Development等國際期刊。 

    在加入國家衛生研究院及系統醫學研究所後，紀博士著手探討核膜蛋白SUN1在人類早 

衰症（Hutchinson-Gilford Progeria syndrome）的角色，發現SUN1在人類早衰症細胞中的不正常堆積，可能是幫助早衰症細胞走向快速老化的一個重要途徑，紀博士並探討基因表觀遺傳修飾因子(Epigenetics Modification Factors)，在神經幹細胞分化中所扮演的角色，其研究結果已陸續投稿於國際期刊。